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ohdsi/broadsea-atlasdb Docker 镜像 - 轩辕镜像

broadsea-atlasdb
ohdsi/broadsea-atlasdb
OHDSI Broadsea系列中的Postgres数据库容器,预配置Atlas/WebAPI应用模式表和Eunomia合成患者数据演示CDM,含预配置用户,用于Atlas应用演示、培训及软件单元测试。
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Broadsea-atlasdb

该容器是OHDSI Broadsea Docker容器集的一部分。

这是一个Docker容器中的Postgres数据库,预配置了OHDSI Atlas/WebAPI应用模式表,并加载了包含合成患者数据(Eunomia)的演示CDM。它还包含一个非常简单的演示概念集和队列定义。有关OHDSI Eunomia SQLite数据库的信息,请参见OHDSI/Eunomia GitHub仓库。

容器包含对基于Atlas数据库的安全的可选支持,预配置了两个Atlas用户:用户ID=ohdsi,密码=ohdsi;用户ID=admin,密码=admin。

此数据库旨在与Broadsea-Webtools Atlas/WebAPI Docker容器配合使用,用于Atlas应用的演示/培训以及Atlas/WebAPI软件的单元测试。

有关使用Broadsea-Webtools和此数据库容器启动Atlas应用的说明及docker-compose.yml文件,请参见OHDSI/Broadsea GitHub仓库的Broadsea 2.0文档。

启动Postgres数据库Docker容器

bash
docker compose up -d

数据库用户ID:postgres
默认密码(可在docker-compose.yml文件中修改):mypass

Postgres数据库数据管理

该容器使用Docker卷管理Postgres数据。如果不存在,它将创建一个名为atlas-db-postgres-data的新Docker卷。Postgres数据库数据将保留在Docker卷中(即使使用docker-compose down/docker-compose up -d重启容器)。

要列出主机服务器上的Docker卷,请使用以下命令:

bash
docker volume ls

要重置Postgres数据库数据,请使用以下命令。注意:此命令将永久删除对演示CDM数据集所做的任何数据更改:

bash
docker volume rm atlasdb-postgres-data

PostgreSQL数据库JDBC连接字符串 - 用于从PostgreSQL客户端连接到此数据库

从运行此数据库容器的本地计算机连接时,使用0.0.0.0作为数据库主机IP地址(或者也可使用127.0.0.1);远程连接时,使用容器所在服务器的IP地址。

text
jdbc:postgresql://0.0.0.0:5432/postgres?user=postgres&password=mypass

GitHub仓库

[***]

许可证

Broadsea-atlasdb采用Apache License 2.0许可证。

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