labsyspharm/s3segmenterS3segmenter是基于Matlab的函数集，用于从深度学习模型生成的概率图中分割细胞（细胞核和细胞质）并生成标记掩码，输入为.ome.tif文件和3类概率图，输出为细胞核、细胞质及细胞的标记掩码等。
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更新时间：2024/01/08 11:25:08
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1.5.7-patch2
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更新时间：2025/11/11 02:27:35
| 层 | 系统架构 | 大小 |
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1.5.7-patch1
docker pull docker.xuanyuan.run/labsyspharm/s3segmenter:1.5.7-patch1
更新时间：2025/11/10 23:41:53
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1.5.7-large
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更新时间：2025/10/28 22:51:12
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1.5.7
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更新时间：2025/10/28 22:49:03
| 层 | 系统架构 | 大小 |
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labsyspharm/quantification
by Harvard Medical School
用于单细胞数据提取的模块，基于分割掩码和多通道图像进行量化分析，输出CSV结构与histoCAT兼容，支持多种图像格式及可配置的量化指标。
10K+ pulls
上次更新：9 个月前
labsyspharm/ashlar
by Harvard Medical School
ASHLAR是一个用于显微镜图像快速高质量拼接和配准的工具，支持CyCIF、CODEX等循环成像方法的多轮共配准，可读取BioFormats支持的显微镜文件或TIFF目录，输出金字塔式分块OME-TIFF，需未拼接的单个tile图像作为输入。
10K+ pulls
上次更新：3 个月前
labsyspharm/unmicst
by Harvard Medical School
UnMICST是用于细胞核识别和组织分割的通用深度学习模型，采用UNet架构生成概率图以提升下游图像二值化准确性，支持多种组织类型，提供solo（仅DNA通道）和duo（DNA+核膜染色）版本，可处理真实显微图像中的复杂形态与伪影。
10K+ pulls
上次更新：10 个月前
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"