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cytomine/core Docker 镜像 - 轩辕镜像

core
cytomine/core
Cytomine核心服务镜像,提供支撑数字病理学平台运行的基础功能,包含医学图像处理、数据管理及协作分析等核心组件。
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Cytomine Core 容器技术文档

1. 镜像概述和主要用途

Cytomine Core 容器是基于 cytomine/tomcat7 镜像构建的核心服务组件,用于部署 Cytomine 平台的核心业务服务。作为 Cytomine 系统的中枢模块,该容器负责处理平台主要业务逻辑,包括数据交互、服务协调、用户认证及核心功能支撑。

2. 核心功能和特性

  • 提供 Cytomine 平台核心业务逻辑处理能力,支撑平台基础功能运行;
  • 基于 Tomcat7 运行环境,确保服务稳定性和兼容性;
  • 通过环境变量配置实现灵活部署,支持与外部服务(如数据库、邮件服务)集成。

3. 使用场景和适用范围

适用于 Cytomine 生物医学图像分析平台的搭建与部署。作为系统核心组件,必须与 postgis(空间数据库)和 mongodb(文档数据库)容器协同工作,共同构成完整的 Cytomine 运行环境。

4. 配置说明

4.1 环境变量

以下环境变量用于配置容器运行参数,需根据实际部署需求设置:

环境变量名说明
CORE_URLCytomine 核心服务的访问 URL
IMS_URLSIMS(图像管理服务)的访问 URL 列表(多个 URL 以逗号分隔)
UPLOAD_URL上传服务的访问 URL
IMS_STORAGE_PATH主机上图像文件的存储路径
IMS_BUFFER_PATH主机上上传图像缓冲区的存储路径
ADMIN_PWD管理员账户密码
ADMIN_PUB_KEY/ADMIN_PRIV_KEY管理员账户的公钥/私钥
SUPERADMIN_PUB_KEY/SUPERADMIN_PRIV_KEY超级管理员账户的公钥/私钥
IMS_PUB_KEY/IMS_PRIV_KEYIMS 服务的公钥/私钥
RABBITMQ_PUB_KEY/RABBITMQ_PRIV_KEYRabbitMQ 服务的公钥/私钥(如有)
SENDER_EMAIL邮件发送者***地址
SENDER_EMAIL_PASS邮件发送者***密码(或授权码)
SENDER_EMAIL_SMTP_HOST邮件发送 SMTP 服务器地址
SENDER_EMAIL_SMTP_PORT邮件发送 SMTP 服务器端口
4.2 端口信息
  • 监听端口:8080
    容器内部通过 8080 端口提供核心服务访问,外部可通过端口映射暴露该服务。

5. 使用方法

5.1 依赖容器

部署前需确保已启动并运行以下容器,且通过 --link 参数建立链接:

  • postgis:提供空间数据库支持;
  • mongodb:提供文档数据库支持。
5.2 部署命令示例

使用 docker run 命令部署,需指定资源限制、环境变量及链接依赖容器。示例命令如下(替换 ${变量} 为实际值):

bash
docker run -m 8g -d -p 8080:8080 \
  --name core \
  --link db:db \          # 链接 postgis 容器(假设 postgis 容器名为 db)
  --link mongodb:mongodb \  # 链接 mongodb 容器(假设容器名为 mongodb)
  -e CORE_URL=${CORE_URL} \  # 核心服务 URL
  -e IMS_URLS=${IMS_URLS} \  # IMS 服务 URL 列表
  -e UPLOAD_URL=${UPLOAD_URL} \  # 上传服务 URL
  -e IMS_STORAGE_PATH=${IMS_STORAGE_PATH} \  # 主机图像存储路径
  -e IMS_BUFFER_PATH=${IMS_BUFFER_PATH} \  # 主机上传缓冲区路径
  -e ADMIN_PWD=${admin_pwd} \  # 管理员密码
  -e ADMIN_PUB_KEY=${ADMIN_PUB_KEY} \  # 管理员公钥
  -e ADMIN_PRIV_KEY=${ADMIN_PRIV_KEY} \  # 管理员私钥
  -e SUPERADMIN_PUB_KEY=${SUPERADMIN_PUB_KEY} \  # 超级管理员公钥
  -e SUPERADMIN_PRIV_KEY=${SUPERADMIN_PRIV_KEY} \  # 超级管理员私钥
  -e IMS_PUB_KEY=${IMS_PUB_KEY} \  # IMS 服务公钥
  -e IMS_PRIV_KEY=${IMS_PRIV_KEY} \  # IMS 服务私钥
  -e SENDER_EMAIL=${SENDER_EMAIL} \  # 发送者***
  -e SENDER_EMAIL_PASS=${SENDER_EMAIL_PASS} \  # 发送者***密码
  -e SENDER_EMAIL_SMTP_HOST=${SENDER_EMAIL_SMTP_HOST} \  # SMTP 服务器地址
  -e SENDER_EMAIL_SMTP_PORT=${SENDER_EMAIL_SMTP_PORT} \  # SMTP 服务器端口
  cytomine/core

参数说明:

  • -m 8g:限制容器内存使用为 8GB;
  • -d:后台运行容器;
  • -p 8080:8080:将容器 8080 端口映射到主机 8080 端口(可根据需求调整主机端口);
  • --link:建立与 postgis(db)和 mongodb 容器的网络链接,确保服务间通信。
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