broadinstitute/cromwell-drs-localizer Docker 镜像 - 轩辕镜像

DRS文件下载工具镜像

镜像概述

本Docker镜像旨在为任务虚拟机(VM)环境提供DRS文件下载功能，通过容器化方式简化DRS（Data Repository Service）格式文件的获取流程，适用于需要自动化或标准化处理DRS文件下载任务的场景。

核心功能与特性

• DRS文件下载：支持在任务VM环境中发起DRS文件下载请求，获取目标DRS格式文件
• 环境适配：针对任务VM环境进行优化，确保在各类任务执行环境中稳定运行
• 轻量化设计：镜像体积精简，资源占用低，适合集成到资源受限的任务处理流程中

使用场景

• 分布式任务处理系统中，作为数据准备阶段的组件，为后续任务提供DRS文件
• 自动化数据流水线中，用于获取DRS格式的源数据文件
• 任务调度平台中，需在任务VM上临时或周期性下载DRS文件的场景

使用方法与配置说明

基本使用命令

bash
docker run --rm \
  -v /path/on/host:/output \  # 挂载宿主机目录用于输出下载的DRS文件
  -e DRS_URL="drs://example.com/path/to/file" \  # 目标DRS文件的URL
  [镜像名称]:[标签]

环境变量说明

数据持久化

通过 -v 参数挂载宿主机目录到容器内的OUTPUT_PATH（默认/output），可将下载的DRS文件持久化到宿主机。

示例：下载指定DRS文件到本地目录

bash
docker run --rm \
  -v /local/drs_downloads:/output \
  -e DRS_URL="drs://data.example.org/dataset1/file.drs" \
  -e TIMEOUT=600 \
  drs-downloader:latest

注意事项

• 确保任务VM已配置Docker运行环境，且具有访问DRS文件源地址的网络权限
• 若DRS文件需要认证，需根据实际DRS服务要求额外配置认证信息（如通过环境变量或挂载配置文件）
• 下载大文件时建议适当调整TIMEOUT参数，避免因超时导致下载中断